个人所得税的计算直接关系到每位劳动者的实际收入，我国现行《个人所得税法》采用综合与分类相结合的税制，对居民个人的工资薪金所得进行征收。其计算并非简单地从工资中扣除固定比例，而是依据一套完整的法律公式和标准，核心在于准确确定应纳税所得额，并适用超额累进税率。
计算过程的第一步是确定应纳税所得额。根据法律规定，居民个人的综合所得（包括工资薪金、劳务报酬、稿酬和特许权使用费），以每一纳税年度的收入额减除费用六万元（即每月五千元的基本减除费用）以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。具体到每月预扣预缴时，累计预扣法被广泛应用。纳税人需将本纳税年度内截至当前月份累计取得的工资薪金收入，减除累计基本减除费用、累计专项扣除（如“三险一金”）、累计专项附加扣除（包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金、赡养老人等七项）以及累计依法确定的其他扣除（如企业年金、商业健康保险等），得出累计预扣预缴应纳税所得额。
第二步是根据计算出的应纳税所得额，查找对应的税率和速算扣除数。工资薪金所得适用七级超额累进税率，税率从3%到45%不等。具体税率表为：不超过36000元的部分，税率为3%；超过36000元至144000元的部分，税率为10%，速算扣除数为2520元；超过144000元至300000元的部分，税率为20%，速算扣除数为16920元；后续级别税率依次提高。计算应纳税额时，以应纳税所得额乘以适用税率，再减速算扣除数，即可得出当期应纳个人所得税额。在月度预扣预缴中，该公式应用于累计应纳税所得额，再减去本年度此前月份已预缴的税款，即为当月应预扣预缴的税额。
举例而言，假设某居民个人每月固定工资收入为15000元，每月个人缴纳的“三险一金”为3000元，享受的专项附加扣除为每月2000元（如赡养老人和住房贷款利息）。则其一月份累计应纳税所得额为：15000 - 5000（基本减除）- 3000 - 2000 = 5000元。该金额位于第一级税率区间，故一月份应预扣预缴税额为5000 × 3% = 150元。至二月份，其累计收入为30000元，累计减除费用为10000元，累计专项扣除为6000元，累计专项附加扣除为4000元，则累计应纳税所得额为30000-10000-6000-4000=10000元。此时累计应纳税额为10000 × 3% = 300元，减去一月份已预缴的150元，二月份应预扣预缴税额为150元。随着累计收入的增加，当累计应纳税所得额跨入更高税率区间时，将适用更高的税率，体现了超额累进的特点。
需要特别指出的是，专项附加扣除制度是税制改革的重要亮点，它充分考虑了个人的差异化负担，使得税负分配更为公平合理。纳税人必须依法通过扣缴义务人或自行向税务机关申报相关信息，才能享受相应扣除。扣缴义务人（通常是雇主）则依法负有按月预扣预缴税款并向税务机关申报解缴的法定义务。每年年度终了后，居民个人还需进行汇算清缴，将全年取得的综合所得合并计算，多退少补，以确保全年应纳税额的准确性。
工资扣缴个人所得税的计算是一个动态、累计的过程，法律设定了清晰的扣除项目和累进税率机制。纳税人应当主动了解相关法律政策，准确填报扣除信息，以维护自身的合法权益，确保税款计算的正确无误。扣缴义务人也应严格履行代扣代缴职责，共同维护国家税收秩序。